在DNA測序過程中,儀器的精確性和可靠性直接影響到實驗結(jié)果的質(zhì)量。任何設(shè)備誤差、信號干擾或系統(tǒng)偏差都可能導(dǎo)致測序結(jié)果的準(zhǔn)確性降低,甚至出現(xiàn)錯誤的分析結(jié)果。因此,定期對賽默飛3500進(jìn)行校準(zhǔn)是確保其準(zhǔn)確運行的關(guān)鍵步驟。
確保測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性:通過校準(zhǔn),能夠排除設(shè)備引起的系統(tǒng)性誤差,保證測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。
提高結(jié)果的重復(fù)性:經(jīng)過校準(zhǔn)的設(shè)備能夠在不同時間點或不同實驗之間提供一致的結(jié)果,提高實驗的可重復(fù)性。
延長設(shè)備使用壽命:定期校準(zhǔn)可以發(fā)現(xiàn)潛在的設(shè)備問題,提前進(jìn)行修復(fù),避免長期使用過程中出現(xiàn)大的故障,從而延長設(shè)備的使用壽命。
進(jìn)行校準(zhǔn)之前,需要對設(shè)備進(jìn)行全面檢查,并做好一些基礎(chǔ)準(zhǔn)備工作。以下是準(zhǔn)備步驟:
設(shè)備清潔:在進(jìn)行校準(zhǔn)前,應(yīng)確保設(shè)備的內(nèi)部和外部清潔無塵。灰塵、污垢或其他污染物可能影響儀器的表現(xiàn),甚至導(dǎo)致誤差。
檢查電源連接:確認(rèn)電源和電源線連接穩(wěn)固且電壓正常,避免因電源不穩(wěn)定引起的校準(zhǔn)失敗。
確保設(shè)備正常啟動:打開設(shè)備后,確保所有指示燈正常亮起,屏幕和控制面板功能正常。如果設(shè)備啟動時存在任何異常,需排查故障。
標(biāo)準(zhǔn)樣品:準(zhǔn)備好標(biāo)準(zhǔn)樣品,這些樣品用于校準(zhǔn)設(shè)備,確保它們與實驗所用的樣品相似。常見的標(biāo)準(zhǔn)樣品包括已知序列的DNA模板,校準(zhǔn)用的混合物等。
校準(zhǔn)軟件:賽默飛3500配備了專門的校準(zhǔn)軟件,通過軟件可監(jiān)控并調(diào)整設(shè)備參數(shù)。確保校準(zhǔn)軟件版本為最新,且與儀器兼容。
實驗室環(huán)境溫度和濕度:環(huán)境溫度和濕度會影響儀器的性能,尤其是液體的蒸發(fā)和氣體的擴散。因此,在進(jìn)行校準(zhǔn)之前,應(yīng)檢查實驗室的溫濕度,確保其在合適的范圍內(nèi)。
首先,啟動賽默飛3500并進(jìn)入其操作界面。確保設(shè)備完全啟動,并進(jìn)入待機模式。隨后,進(jìn)行初始化操作,包括傳感器檢測、系統(tǒng)自檢等。
賽默飛3500的校準(zhǔn)程序通常通過專用的校準(zhǔn)軟件啟動。用戶需要在操作界面中選擇“校準(zhǔn)”選項,進(jìn)入校準(zhǔn)流程。此時,系統(tǒng)會提示用戶選擇校準(zhǔn)類型,例如“定期校準(zhǔn)”或“自定義校準(zhǔn)”。
賽默飛3500的核心部件之一是其光學(xué)系統(tǒng),光學(xué)系統(tǒng)的校準(zhǔn)至關(guān)重要。光學(xué)系統(tǒng)包含激光、光源和探測器等部件。進(jìn)行校準(zhǔn)時,用戶需要:
檢查激光穩(wěn)定性:確保激光光源工作穩(wěn)定,輸出功率符合標(biāo)準(zhǔn)。
調(diào)整光源位置:通過校準(zhǔn)軟件,調(diào)整光源的照射角度和光斑位置,確保其能夠覆蓋整個測序區(qū)域。
光學(xué)檢測系統(tǒng)校準(zhǔn):校準(zhǔn)探測器的靈敏度,確保其在整個檢測范圍內(nèi)能夠準(zhǔn)確捕捉到信號。
流動池和測序芯片是賽默飛3500中用于捕獲DNA片段和測序信號的重要部件。在校準(zhǔn)過程中,檢查流動池是否完全清潔,且芯片的安裝位置正確。
流動池清潔:使用專業(yè)的清潔劑,定期對流動池進(jìn)行清潔,避免任何污染物影響測序過程。
芯片定位校準(zhǔn):確保芯片放置在設(shè)備的測序位置上,并檢查其與激光和探測器的對準(zhǔn)情況。
電源系統(tǒng)校準(zhǔn):檢查設(shè)備的電源系統(tǒng),確保其為穩(wěn)定電壓輸出,避免電壓波動影響設(shè)備穩(wěn)定運行。
氣流和溫控系統(tǒng)校準(zhǔn):確保設(shè)備的溫度和氣流系統(tǒng)能夠穩(wěn)定運行,以保持最佳的測序環(huán)境。
賽默飛3500的校準(zhǔn)不僅依賴硬件,還需要通過軟件來監(jiān)控和調(diào)節(jié)系統(tǒng)參數(shù)。校準(zhǔn)過程中的每一個步驟都應(yīng)通過軟件進(jìn)行記錄,并根據(jù)軟件給出的反饋調(diào)整設(shè)備參數(shù)。
完成上述步驟后,進(jìn)行一次校準(zhǔn)測試,使用標(biāo)準(zhǔn)樣品進(jìn)行測序,并與預(yù)期的測序結(jié)果進(jìn)行對比。通過分析樣品的測序數(shù)據(jù),可以驗證設(shè)備是否已經(jīng)被成功校準(zhǔn)。
校準(zhǔn)結(jié)束后,進(jìn)行必要的驗證工作。通過再次測序標(biāo)準(zhǔn)樣品,驗證校準(zhǔn)是否成功,測序結(jié)果是否符合預(yù)期。校準(zhǔn)后的數(shù)據(jù)應(yīng)保存為記錄文件,以便未來參考。
重復(fù)測序:使用相同的標(biāo)準(zhǔn)樣品進(jìn)行多次測序,確認(rèn)測序結(jié)果的一致性。
數(shù)據(jù)對比:與已有的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)進(jìn)行比對,確認(rèn)測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。
自動記錄:賽默飛3500的校準(zhǔn)軟件會自動記錄每次校準(zhǔn)的時間、操作步驟和校準(zhǔn)結(jié)果。
手動記錄:在設(shè)備的維護(hù)手冊中詳細(xì)記錄每次校準(zhǔn)的細(xì)節(jié),包括使用的標(biāo)準(zhǔn)樣品、校準(zhǔn)人員等信息,以備將來查閱。
可能原因:設(shè)備的硬件故障、軟件設(shè)置錯誤、環(huán)境因素等都可能導(dǎo)致校準(zhǔn)失敗或數(shù)據(jù)不一致。
解決方法:重新檢查設(shè)備硬件,確保所有部件工作正常;檢查校準(zhǔn)軟件的設(shè)置,確認(rèn)是否有誤;在合適的實驗室環(huán)境下進(jìn)行校準(zhǔn)。
可能原因:光源或探測器的損壞、老化,或安裝位置不正確。
解決方法:檢查光學(xué)部件,確保其正常工作并且沒有受到損壞。如果有損壞,及時更換部件。
可能原因:流動池污染或芯片安裝不當(dāng)。
解決方法:定期清潔流動池,確保沒有雜質(zhì)影響測序。檢查芯片是否正確安裝,調(diào)整位置。
可能原因:校準(zhǔn)軟件的版本不兼容或設(shè)置錯誤。
解決方法:確保使用最新版本的校準(zhǔn)軟件,并仔細(xì)檢查軟件設(shè)置,避免操作失誤。
定期校準(zhǔn):建議每3至6個月進(jìn)行一次校準(zhǔn),尤其在長時間未使用后或設(shè)備出現(xiàn)異常時,應(yīng)及時校準(zhǔn)。
定期檢查:除了定期校準(zhǔn)外,還應(yīng)定期檢查設(shè)備的硬件,如電源、激光、光學(xué)系統(tǒng)等,確保其保持在最佳工作狀態(tài)。
使用標(biāo)準(zhǔn)樣品:每次校準(zhǔn)時使用經(jīng)過驗證的標(biāo)準(zhǔn)樣品,確保測序結(jié)果的可靠性。
賽默飛3500是一款高精度的DNA測序儀,定期的校準(zhǔn)不僅能確保其穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性,還能有效提高實驗結(jié)果的可靠性。通過遵循系統(tǒng)的校準(zhǔn)流程,及時進(jìn)行硬件和軟件的檢查與調(diào)整,可以大大提升設(shè)備的使用效率,減少故障發(fā)生。校準(zhǔn)工作雖然繁瑣,但它對于保證DNA測序?qū)嶒灥某晒χ陵P(guān)重要,因此應(yīng)當(dāng)引起每一位操作人員的高度重視。
杭州實了個驗生物科技有限公司